KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 gromacs-2018.6 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템뉴론 (GPU Cluster System) OS Version리눅스 / CentOS 7.4 CPUIntel Xeon E5-2670 v2 GPUNVIDIA Tesla V100 컴파일러Intel 2018.2 Version MPImvapich2 2.3 기타 Intel MKL Math LibraryCUDA 10.0 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 modu..

본 문서는 누리온 시스템에서 OpenFOAM 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, OpenFOAM 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다.OpenFOAM 사용법에 대한 정보는 OpenFOAM 사이트(https://www.openfoam.com, https://openfoam.org, http://openfoamwiki.net)를 참고하시기 바랍니다. 1. 소프트웨어 설치 정보(1) 설치 버전 - 4.1(KNL, SKL), 5.0(KNL, SKL), 7.0(KNL, SKL),..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 장비에 lammps-16Mar18 source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템뉴론 OS Version리눅스 / CentOS 7.4 CPUIntel Xeon E5-2670 v2 컴파일러Intel 2018 Version MPIMvapich2 2.3 Version 기타 Intel MKL Math Library, CUDA 10.0 2. 설치 전 환경 설정KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법..

이 문서는 GROMACS-2016.4 소스를 (CUDA 기반의) GPU 기능을 사용하는 버전으로 빌드하는 방법에 대해 소개한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템뉴론 (GPU Cluster System) OS Version리눅스 / CentOS 7.4 CPUIntel Xeon E5-2670 v2 컴파일러intel compiler 2018.0.2 GPUNVIDIA Tesla V100 기타 intel mkl mvapich2 2.3CUDA 10.0 2. 설치 과정 소스 파일은 아래 사이트에서 다운로드 받을 수 있다. http://www.gromacs.org GROMACS 소스 압축 풀기 & 빌드할 디렉토리 생성 $ tar xzf gromacs-2016.4.tar.gz $ cd gromacs-2016.4 $..

안녕하십니까? 한국과학기술정보연구원 슈퍼컴퓨팅인프라센터입니다. 슈퍼컴퓨팅인프라센터에서는 국내 연구자들에게 최고의 연구 환경을 제공하기 위해 슈퍼컴퓨터 5호기(Nurion)를 서비스하고 있습니다. 슈퍼컴 5호기(Nurion)시스템이 인텔 매니코어 및 x86 아키텍쳐로 구성됨에 따라 연구자들의 다양한 연구환경(GPU를 통한 성능 가속이 뛰어난 HPC, 기계학습 및 빅데이터 분야의 연구/개발)을 지원하기 위해, GPU 클러스터(KAT)시스템을 2019년 5일 9일부터 공식 서비스 오픈 합니다. 1. 서비스 일정 o KAT 시스템 서비스 오픈 : 2019년 5월 9일(목) 10:00 o [공식서비스(무상)] 사용자 코드 포팅 : 2019년 5월 9일 ~ 2019년 6월 30일 o [공식서비스(유·무상)] KAT..

아나콘다(Anaconda)는 PYTHON 과 R 프로그래밍 언어로 된 과학 컴퓨팅(데이터 과학, 기계 학습 응용 프로그램, 대규모 데이터 처리, 예측 분석 등)분야의 패키지들의 모음을 제공하는 배포판이다.Anaconda 배포판은 1,200 만 명이 넘는 사용자가 사용하며 Windows, Linux 및 MacOS에 적합한 1400 가지 이상의 인기있는 데이터 과학 패키지를 포함한다.Anaconda를 설치하기 위해서는 https://www.anaconda.com 웹사이트에서 자신의 OS에 맞는 배포판을 다운받아 설치하면 된다.(예) Windows, MacOS, Linux현재 Anaconda 는 Python 3.7 기반의 버전과 Python 2.7 기반의 버전을 제공한다. conda 는 아나콘다에서 패키지 버..

본 문서는 누리온 시스템에서 가우시안 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, 가우시안 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 가우시안 소개 가우시안은 에너지, 분자구조 및 진동주파수를 예측하는 분자 모델링 패키지이며, 화학, 물리, 생명과학, 공학 분야 연구자를 위한 프로그램입니다. 자세한 사항은 가우시안 사의 홈페이지를 통해 얻을 수 있습니다. 홈페이지 주소: http://gaussian.com 2. 설치 버전 및 라이선스 - KISTI 슈퍼컴퓨팅센터는 가우시안 16..

본 문서는 누리온 시스템에서 NASTRAN 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, NASTRAN 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 사용 정책 - 사용자별 최대 40개 CPU 코어 수행 가능합니다. - 한정된 라이선스를 슈퍼컴 사용자들이 함께 사용하므로, 사용정책 기준을 초과하여 사용할 경우 해당 작업은 관리자가 강제 종료 합니다. - 부득이하게 많은 라이선스가 필요할 경우, KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)를 통해 사전에 관리자와 협의..

본 문서는 누리온 시스템에서 LS-DYNA 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, LS-DYNA 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 사용 정책 - 사용자별 최대 40개 CPU 코어 수행 가능합니다. - 한정된 라이선스를 슈퍼컴 사용자들이 함께 사용하므로, 사용정책 기준을 초과하여 사용할 경우 해당 작업은 관리자가 강제 종료 합니다. - 부득이하게 많은 라이선스가 필요할 경우, KISTI 홈페이지(https://www.ksc.re.kr)를 통해 사전에 관리자와 협의해..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 UPPV3.1 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2018.3 Version MPI IntelMPI 2018.3 Version 기타 WRFV3.9.1.1 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 설정 ] $ module ..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 OpenFOAM-v1712 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2018.3 MPI IntelMPI 2018.3 기타 2. 설치 전 환경 설정 OpenFOAM-v1712 버전 설치에 필요한 gmp, mpfr, mpc, boost, CGAL 는 누리온 시스템에 미리 설치된 /apps/common 라이브러리들을 사용한다. 만약 다른 버전의 gmp, mpfr, mpc, boost, CGAL 가 필요한 경우는 사용자의 홈 디렉토리(/home01/$USER)에 설치 후 환경설정을 해서..

안녕하십니까? 슈퍼컴퓨팅본부입니다. 지난 3차 베타서비스에 이어 V100 GPU 9대를 추가한 KAT시스템을 아래와 같이 4차 베타서비스 합니다. GPU 컴퓨팅 및 최신 아키텍쳐의 CPU사용에 관심 있는 사용자분들께서는 사용신청해주시기 바랍니다. 1. 베타서비스 기간 2018년 12월 10일~2019년 2월 9일 (2개월간, 추후 변경가능) 2. 대상 GPU 활용이 필요한 연구 주제를 보유한 연구자 3. 신청기간 2018년 11월 21일 ~ 2018년 11월 29일까지 4. 신청방법 연구지원프로그램 신청시스템 ( https://enables.ksc.re.kr )을 통해 신청 5. 시스템 사양 계산노드 - 총 42노드 - single K40 GPU 8노드 (노드당 K40카드 한장) - dual V100 G..

안녕하십니까? 슈퍼컴퓨팅센터입니다. 지난 1차 베타서비스에 이어 빅메모리노드와 skylake CPU 노드를 추가한 KAT시스템을 아래와 같이 2차 베타서비스 합니다. GPU 컴퓨팅 및 최신 아키텍쳐의 CPU사용에 관심 있는 사용자분들께서는 사용신청해주시기 바랍니다. 1. 베타서비스 기간: 2018년 5월 1일~2018년 7월 31일 (3개월간, 추후 변경가능) 2. 대상: 현재 슈퍼컴퓨팅 계정을 보유하고 있는 사용자 3. 신청기간: 2018년 4월 19일 ~ 2018년 4월 25일까지 4. 신청방법: 첨부파일의 신청방법을 참고하여 연구지원프로그램 신청시스템 (https://enables.ksc.re.kr )을 통해 신청 5. 시스템 사양: 계산노드 - 총 42노드 - K40 GPU 17노드 - V100 ..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터에서 무료로 진행하는 2017년도 하반기 슈퍼컴퓨팅교육 일정을 알려드립니다. 각 교육에 대한 세부 정보 및 접수현황 등은 아래 사이트에서 확인하실 수 있습니다. 참고로 아래 소개하는 모든 교육은 KISTI 슈퍼컴퓨팅센터 교육실 (대전)에서 이루어집니다. 교육센터 홈페이지: http://webedu.ksc.re.kr/ 2 0 1 7 7월 강의명 교육날짜 기간 Tachyon2 시스템 활용 2017.07.7(금) 1일 Fortran 2017.07.20(목) ~ 2017.07.21(금) 2일 2 0 1 7 8월 강의명 교육날짜 기간 OpenMP 초급/중급 2017.08.10(목) ~ 2017.08.11(금) 2일 MPI 초급/중급 2017.08.24(목) ~ 2017.08.25(금) 2일..

vasp.5.4.1.24Jun15 버전은 버그가 있어 패치가 필요한것으로 알려져 있다.아래 내용들을 참고 하여 vasp 설치 전 패치를 진행해야 오류가 발생하지 않는다. [참고 주소]- vasp site : https://www.vasp.at/index.php/news/archive- vasp wiki site : http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/Installing_VASP [패치 파일 목록]vasp download portal 또는 vasp wiki 에서 다운 로드 가능.- patch.5.4.1.08072015.gz- patch.5.4.1.27082015.gz- patch.5.4.1.06112015.gz [패치 방법]각 압축 파일을 Gunzip 후 vasp...