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누리온 OpenFOAM-v1712 설치 소개

슈퍼컴퓨팅인프라센터 2018. 12. 20. 11:20

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 OpenFOAM-v1712 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.


1. 설치 환경

 구분

내용

 대상 시스템

 누리온

OS Version 

 리눅스 / CentOS 7.3

 CPU

 Intel(R) Xeon(R) Gold 6126

 컴파일러

 Intel 2018.3

 MPI

 IntelMPI 2018.3 

 기타

  


2. 설치 전 환경 설정

 OpenFOAM-v1712 버전 설치에 필요한 gmp, mpfr, mpc, boost, CGAL 는 누리온 시스템에 미리 설치된 /apps/common 라이브러리들을 사용한다.

 만약 다른 버전의 gmp, mpfr, mpc, boost, CGAL  가 필요한 경우는 사용자의 홈 디렉토리(/home01/$USER)에 설치 후 환경설정을 해서 사용하면 된다.


[ 환경 설정 ]

 $ module load cmake/3.12.3

 $ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3


3. OpenFOAM-v1712 버전 설치 과정

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고,

 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.  
 설치 소개 시 사용된 경로 /scratch/optpar02 는 설치 안내를 위한 경로 이므로 실제 사용되는 경로를 사용한다.

 설치 과정

 $ cd /scratch/optpar02

 $ mkdir OpenFOAM

 $ cd OpenFOAM

 $ tar -xzf OpenFOAM-v1712.tgz

 $ tar -xzf ThirdParty-v1712.tgz

 $ vi OpenFOAM-v1712/etc/config.sh/settings 

  - - - [settings 수정 사항] 참고 - - -

 $ sed -i -e 's/\(boost_version=\)boost_1_64_0/\1boost-system/' OpenFOAM-v1712/etc/config.sh/CGAL

 $ sed -i -e 's/\(cgal_version=\)CGAL-4.9.1/\1cgal-system/' OpenFOAM-v1712/etc/config.sh/CGAL

 $ vi OpenFOAM-v1712/etc/bashrc 

  - - - [bashrc 수정 사항] 참고 - - -

 $ source OpenFOAM-v1712/etc/bashrc 

 $ mkdir -p $WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/$WM_ARCH$WM_COMPILER

 $ ln -s /apps/common/gmp/6.1.2          $WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/$WM_ARCH$WM_COMPILER/gmp-system

 $ ln -s /apps/common/mpfr/4.0.1         $WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/$WM_ARCH$WM_COMPILER/mpfr-system

 $ ln -s /apps/common/mpc/1.1.0          $WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/$WM_ARCH$WM_COMPILER/mpc-system

 $ ln -s /apps/common/boost/1.68.0       $WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/$WM_ARCH$WM_COMPILER/boost-system

 $ ln -s /apps/common/CGAL/4.9.1         $WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/$WM_ARCH$WM_COMPILER/cgal-system

 $ ln -s /apps/applications/cmake/3.12.3  $WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/$WM_ARCH$WM_COMPILER/cmake-system

 $ cd $WM_PROJECT_DIR
 $ ./Allwmake


[settings 수정 사항] 

 25line : export WM_CFLAGS="-fPIC -xCOMMON-AVX512"

 26line : export WM_CXXFLAGS="-fPIC -std=c++11 -xCOMMON-AVX512"

※ SKL 계산노드와 KNL 계산노드 모두 실행할 수 있는 "-xCOMMON-AVX512" 로 안내하고, 필요 시 변경해서 사용


[bashrc 수정 사항] 

 45line : FOAM_INST_DIR=/scratch/optpar02/$WM_PROJECT

 65line : export WM_COMPILER=Icc

 88line : export WM_MPLIB=INTELMPI

※ 위 수정 예제에서 /scratch/optpar02 경로는 설치 테스트 시 사용된 경로이므로 변경 후 사용


4. 테스트

 $ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3

 $ source /scratch/optpar02/OpenFOAM/OpenFOAM-v1712/etc/bashrc 


 $ mkdir -p $FOAM_RUN 

 $ run 

 $ cp -r $FOAM_TUTORIALS/incompressible/simpleFoam/pitzDaily .

 $ cd pitzDaily 

 $ blockMesh 

 $ simpleFoam 


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