KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

KISTI 뉴론 시스템에 lammps-27Oct2021버전을 설치하는 방법에 대해 소개한다. 설치 과정 소개는 tar 파일을 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법 등의 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다. 1. 설치환경 구분 내용 대상 시스템 뉴론 OS Version 리눅스 / CentOS 7.9 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 5217 CPU @ 3.00GHz 컴파일러 GCC 10.2.0 MPI CUDA OpenMPI 4.1.1 기타 CUDA 11.4 2. 설치 전 환경설정 뉴론 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 손쉽게 설정하기 위하여, OpenSource 프로그램인 Environment Modules(https://modules.source..

KISTI 누리온/뉴론 시스템에 RASPA2-2.0.47 버전을 설치하는 방법에 대해 소개한다. 설치 과정 소개는 tar 파일을 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법 등의 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다. 1. 설치환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250 / Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2018.3 Version MPI Intel MPI 2018.3 Version 기타 Intel Math Kernel Library 2. 설치 전 환경설정 누리온/뉴론 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 손쉽게 설정하기 위하여, O..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템의 SKL 사용 시 gromacs-2021.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온(SKL) OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2021.4 Version MPI IntelMPI 2021.4 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템의 KNL 사용 시 gromacs-2021.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온(KNL) OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250 컴파일러 Intel 2021.4 Version MPI IntelMPI 2021.4 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 장비에 lammps-3Mar20 source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2019.5 Version MPI IntelMPI 2019.5 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 설정 ] $ module..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 장비에 lammps-3Mar20 source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2019.5 Version MPI IntelMPI 2019.5 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 설정 ] $ module..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 장비에 Quantum Espresso-6.6 source 버전으로 설치하는 방법에 대하여 소개한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2019.0.5 Version MPI IntelMPI 2019.0.5 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개에서는 module load..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 DDSCAT-7.3.3 Source 버전으로 설치하는 방법에 대하여 소개한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 intel 2018.3 MPI intel mpi 2018.3 기타 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 설정하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 설정 ] $ module load intel/18.0.3 imp..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 뉴론 시스템에 qe-6.6 버전을 설치하는 방법에 대하여 소개한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 뉴론 OS Version 리눅스 / CentOS 7.4 CPU Intel Xeon E5-2670 v2 컴파일러 PGI 2019 Version MPI Openmpi 3.1.0 Version 기타 CUDA 10.0 2. 설치 전 환경 설정 KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 설정 ] $ module load ..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 AutoDock Vina-1.1.2 Source 버전으로 설치하는 방법에 대하여 소개한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 gcc 4.8.5 / intel 2018.3 MPI 기타 2. 설치 전 환경 설정누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 설정하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,이하 설치 소개에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 설정 ]1) GNU 컴파일러 사용 시- 별도의 환경설정 불필요 2..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 ParaView-v5.2.0 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2018.3 MPI Intel MPI 2018.3 기타 2. 설치 전 환경 설정누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 설정하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 설정 ] $ module load intel/18.0.3 ..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 foam-extend-3.1 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Gcc 7.2.0 MPI OpenMPI 3.1.0 기타 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 설정하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 설정 ] $ module load gcc/7.2.0 openmp..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 CP2K-v6.1.0 Source 버전으로 공용 파일시스템인 /apps에 설치했던 내용을 정리하여 사용자들이 설치하는 방법에 대하여 참고할 수 있도록 내용을 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250 컴파일러 Gcc 7.2.0 MPI OpenMPI 3.1.0 기타 Cmake 3.12.3 2. 설치 전 환경 설정 CP2K 설치에는 여러 의존성 패키지들이 필요하다. 본 내용은 컴파일러와 MPI, CMAKE를 제외한 의존 라이브러리들을 CP2K 의 toolchain 을 이용하는 방법으로 소개한다. [ 환경 설정 ] $ module load ..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 뉴론 시스템에 OpenFOAM-v1912 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 뉴론OS Version 리눅스 / CentOS 7.4 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6140 컴파일러 Intel 2018.2 MPI IntelMPI 2018.2 기타 2. 설치 전 환경 설정 OpenFOAM-v1912 버전 설치에 필요한 gmp, mpfr, mpc, boost, CGAL 는 뉴론 시스템에 미리 설치된 /apps/common 라이브러리들을 사용한다. 만약 다른 버전의 gmp, mpfr, mpc, boost, CGAL 가 필요한 경우는 사용자의 홈 디렉토리(/home01/$USER)에 설치 후 환경설정을 해서 사용..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 OpenFOAM-v1912 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2018.3 MPI IntelMPI 2018.3 기타 2. 설치 전 환경 설정 OpenFOAM-v1912 버전 설치에 필요한 gmp, mpfr, mpc, boost, CGAL 는 누리온 시스템에 미리 설치된 /apps/common 라이브러리들을 사용한다. 만약 다른 버전의 gmp, mpfr, mpc, boost, CGAL 가 필요한 경우는 사용자의 홈 디렉토리(/home01/$USER)에 설치 후 환경설정을 해서..