KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

누리온 UPPV3.1 설치 소개 본문

SW 설치 문서 창고/누리온(NURION)

누리온 UPPV3.1 설치 소개

슈퍼컴퓨팅인프라센터 2019. 1. 7. 13:59

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 UPPV3.1 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.


1. 설치 환경

 구분

내용

 대상 시스템

 누리온

OS Version 

 리눅스 / CentOS 7.3

 CPU

 Intel(R) Xeon(R) Gold 6126

 컴파일러

 Intel 2018.3 Version

 MPI

 IntelMPI 2018.3 Version

 기타

 WRFV3.9.1.1


2. 설치 전 환경 설정

  누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 

  환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,

  이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.


[ 환경 설정 ]

 $ module load craype-x86-skylake intel/18.0.3 impi/18.0.3

 $ module load hdf4/4.2.13 hdf5/1.10.2 netcdf/4.6.1 ncl/6.5.0

 $ export JASPERLIB=/apps/common/jasper/1.900.29/lib

 $ export JASPERINC=/apps/common/jasper/1.900.29/include


3. 설치 과정

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고,
 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.  

 설치 과정

tar xvzf DTC_upp_v3.1.tar.gz

cd UPPV3.1

./configure 

 - - - - - [configure 과정 진행 내용] 참고

$ vi configure.upp

 - - - - - [configure.upp 파일 수정 수정 내용] 참고

./compile 

※ UPP는 WRF 경로 설정을 별도로 하지 않기 위하여 아래와 같이 WRF와 동일 경로 상에 설치 하였다.

   만약 다른 경로에 WRF 가 있다면 WRF_DIR 설정이 필요함.


[configure 과정 진행 내용]

$ ./configure

Will use NETCDF in dir:  /apps/compiler/intel/18.0.3/applib1/mic-knl/netcdf/4.6.1

Will use WRF in dir: /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/../WRFV3

configure: making ./bin

bindir  /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/bin

configure: making ./include

incmod  /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/include

configure: making ./lib

libdir  /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/lib

JASPER Environent found :: GRIB2 library ::

grib2lib = -L/apps/common/jasper/1.900.29/lib -lpng -lz -ljasper

grib2inc = -I/apps/common/jasper/1.900.29/include

-------------------------------------------------------------------------

Please select from among the following supported platforms.


   1.  Linux x86_64, PGI compiler  (serial)

   2.  Linux x86_64, PGI compiler  (dmpar)

   3.  Linux x86_64, Intel compiler (serial)

   4.  Linux x86_64, Intel compiler (dmpar)

   5.  Linux x86_64, Intel compiler, SGI MPT (serial)

   6.  Linux x86_64, Intel compiler, SGI MPT (dmpar)

   7.  Linux x86_64, gfortran compiler  (serial)

   8.  Linux x86_64, gfortran compiler  (dmpar)

   9.  Linux x86_64, Intel compiler, IBM POE (serial)

  10.  Linux x86_64, Intel compiler, IBM POE (dmpar)

  11.  Linux x86_64, gfortran compiler: -f90=gfortran  (serial)

  12.  Linux x86_64, gfortran compiler: -f90=gfortran  (dmpar)

  13.  Linux x86_64, PGI compiler: -f90=pgf90  (serial)

  14.  Linux x86_64, PGI compiler: -f90=pgf90  (dmpar)


Enter selection [1-14] : 4

-------------------------------------------------------------------------

Configuration successful. To build the UPP, type: compile 

-------------------------------------------------------------------------


[configure.upp 파일 수정 수정 내용]

DM_FC  = mpiifort

DM_F90 = mpiifort -free

DM_CC  = mpiicc

 

FOPT    = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512

CRTMOPT = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512

COPT    = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512

 

GRIB2SUPT_LIB   =    -L/apps/common/jasper/1.900.29/lib -L/apps/common/libpng/1.2.56/lib -lpng -lz -ljasper

GRIB2SUPT_INC   =    -I/apps/common/jasper/1.900.29/include -I/apps/common/libpng/1.2.56/include

※ 누리온 시스템 설치 예제는 SKL/KNL 계산노드에서 공통적으로 사용을 위해 "-xCOMMON-AVX512" 로 작성

 - SKL(skylake) 노드 전용 : -xCORE-AVX512

 - KNL(Intel Xeon Phi Knights Landing) 전용 : -xMIC-AVX512

 - SKL 과 KNL 공통 적용 : -xCOMMON-AVX512

 - 참고 :  https://software.intel.com/en-us/articles/compiling-for-the-intel-xeon-phi-processor-and-the-intel-avx-512-isa

0 Comments
댓글쓰기 폼