KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

KISTI 국가슈퍼컴퓨팅센터는 초고성능컴퓨팅(High Performance Computing) 육성법에 근거하여 국가 차원의 초고성능컴퓨팅 자원을 지원하고 있습니다. 초고성능컴퓨팅 기반 RnD 혁신지원 프로그램 연구과제에 대해 아래와 같이 공모하오니, 희망 연구자는 마감일을 지켜 신청서를 제출해 주시기 바랍니다. ㅇ 프로그램명 : 슈퍼컴퓨터 5호기 초고성능컴퓨팅 기반 RnD 혁신지원 프로그램(2023년 1차분) ㅇ 지원자격 : 초고성능컴퓨터를 활용하여 계산과학, 제조혁신, 인공지능 등의 연구개발을 수행하고자 하는 국내 재직 중인 박사급 이상 연구자 또는 이에 준하는 경력 연구자(학사후 10년, 석사후 5년), 단, 외국인의 경우 post doc.은 가능, 방문 연구원은 제외 ㅇ 지원분야 : 거대연구 및 ..

KISTI 뉴론 시스템에 lammps-27Oct2021버전을 설치하는 방법에 대해 소개한다. 설치 과정 소개는 tar 파일을 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법 등의 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다. 1. 설치환경 구분 내용 대상 시스템 뉴론 OS Version 리눅스 / CentOS 7.9 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 5217 CPU @ 3.00GHz 컴파일러 GCC 10.2.0 MPI CUDA OpenMPI 4.1.1 기타 CUDA 11.4 2. 설치 전 환경설정 뉴론 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 손쉽게 설정하기 위하여, OpenSource 프로그램인 Environment Modules(https://modules.source..

KISTI 누리온/뉴론 시스템에 RASPA2-2.0.47 버전을 설치하는 방법에 대해 소개한다. 설치 과정 소개는 tar 파일을 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법 등의 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다. 1. 설치환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250 / Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2018.3 Version MPI Intel MPI 2018.3 Version 기타 Intel Math Kernel Library 2. 설치 전 환경설정 누리온/뉴론 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 손쉽게 설정하기 위하여, O..

KISTI 국가슈퍼컴퓨팅센터는 초고성능컴퓨팅(High Performance Computing) 육성법에 근거하여 국가 차원의 초고성능컴퓨팅 자원을 지원하고 있습니다. 초고성능컴퓨팅 기반 RnD 혁신지원 프로그램 연구과제에 대해 아래와 같이 공모하오니, 희망 연구자는 마감일을 지켜 신청서를 제출해 주시기 바랍니다. ㅇ 프로그램명 : 슈퍼컴퓨터 5호기 초고성능컴퓨팅 기반 RnD 혁신지원 프로그램(2022년 3차분) ㅇ 지원자격 : 초고성능컴퓨터를 활용하여 계산과학, 제조혁신, 인공지능 등의 연구개발을 수행하고자 하는 국내 재직 중인 박사급 이상 연구자 또는 이에 준하는 경력 연구자(학사후 10년, 석사후 5년), 단, 외국인의 경우 post doc.은 가능, 방문 연구원은 제외 ㅇ 지원분야 : 거대연구 및 ..

어셈블리(Assembly) 언어란? 어셈블리어란 사용자가 이해하기 어려운 기계어 대신에 명령 기능을 쉽게 연상할 수 있는 기호를 기계어와 대응시켜 코드화한 언어 어셈블리어로 작성한 프로그램은 어셈블러를 통해 오브젝트 코드(기계어)로 변환하는 과정(어셈블)을 거쳐야 함 어셈블리 언어를 배워야 하는 이유 ○ 어셈블리 언어를 배워야 하는 이유는 다음과 같다: 참고: x86-64 Assembly Language Programming with Ubuntu (Jorgensen) 하드웨어 구조에 대한 이해를 돕는다. 기본적인 명령어, 레지스터, 메모리 접근방식, 하드웨어 인터페이싱에 대해 더 잘 이해할 수 있다. 툴 체인에 대한 이해: 컴파일러, 어셈블러, 링커, 로더, 디버거와 같은 도구의 세부사항을 이해할 수 있..

■ 뉴론 시스템 노드 정책 변경 안내 정책 변경시점 : 2022년 3월 17일 예방정비 점검(PM) 이후 정책 적용 파티션 : 모든 파티션 변경 내용 : 배타적 노드 할당 정책 -> 공유 노드 정책 ※배타적 노드 할당 정책 : 노드 단위 작업 할당 정책으로, 하나의 노드에 하나의 작업만을 할당 ※공유 노드 정책 : CPU 단위 할당 정책으로, 유휴 자원(CPU)이 존재하는 노드에 사용자 작업을 할당하는 방식이며, 하나의 노드에 여러 작업이 할당될 수 있음 ■ 뉴론 공유 노드 정책에서 메모리 할당량 설정 - 뉴론 시스템 자원 활용의 효율성 및 사용자의 안정적인 작업 수행을 위하여 아래와 같이 메모리 할당량을 자동 조절 memory-per-node = ntasks-per-node * cpus-per-task..

슈퍼컴퓨팅본부에서는 KISTI 슈퍼컴퓨터 사용자지원 정책에 따라 계산과학/공학 분야의 연구를 위해 대규모 병렬 계산 또는 첨단 계산 기법을 필요로 하는 슈퍼컴퓨터 사용자들을 지원하고 있습니다. 지원의 일환으로 사용자들이 슈퍼컴퓨터를 이용하여 문제 해결에 필요한 시간을 단축하거나, 현재보다 훨씬 더 큰 규모의 문제에 도전하는 등 보다 높은 연구 생산성을 얻을 수 있도록 성능최적화 및 병렬화를 지원합니다. 당면한 문제해결에 국한된 단기적인 성능최적화지원을 뛰어넘어 중·장기적인 지원을 통해 기존 연구 주제를 계산 규모나 성능 측면에서 큰 폭으로 확장할 수 있는 주제를 발굴하고 지원을 제공하기 위해 진행됩니다. 1. 업무 범위 공모를 통해 진행될 과제에서는 사용자 코드로는 계산이 불가능한 대규모 문제를 풀기 위..

슈퍼컴퓨팅본부에서는 KISTI 슈퍼컴퓨터 사용자지원 정책에 따라 계산과학/공학 분야의 연구를 위해 대규모 병렬 계산 또는 첨단 계산 기법을 필요로 하는 슈퍼컴퓨터 사용자들을 지원하고 있습니다. 올해는 NVIDIA와 함께 GPU기반 최적 병렬화와 AI 관련 연구협력 프로그램을 시작합니다. 지원의 일환으로 사용자들이 슈퍼컴퓨터를 이용하여 문제 해결에 필요한 시간을 단축하거나, 현재보다 훨씬 더 큰 규모의 문제에 도전하는 등 보다 높은 연구 생산성을 얻을 수 있도록 성능최적화 및 병렬화를 지원합니다. 당면한 문제해결에 국한된 단기적인 성능최적화지원을 뛰어넘어 중·장기적인 지원을 통해 기존 연구 주제를 계산 규모나 성능 측면에서 큰 폭으로 확장할 수 있는 주제를 발굴하고 지원을 제공하기 위해 진행됩니다. 1. ..

슈퍼컴퓨팅본부에서는 KISTI 슈퍼컴퓨터 사용자지원 정책에 따라 계산과학/공학 분야의 연구를 위해 대규모 병렬 계산 또는 첨단 계산 기법을 필요로 하는 슈퍼컴퓨터 사용자들을 지원하고 있습니다. 지원의 일환으로 사용자들이 슈퍼컴퓨터를 이용하여 문제 해결에 필요한 시간을 단축하거나, 현재보다 훨씬 더 큰 규모의 문제에 도전하는 등 보다 높은 연구 생산성을 얻을 수 있도록 성능최적화 및 병렬화를 지원합니다. 당면한 문제해결에 국한된 단기적인 성능최적화지원을 뛰어넘어 중·장기적인 지원을 통해 기존 연구 주제를 계산 규모나 성능 측면에서 큰 폭으로 확장할 수 있는 주제를 발굴하고 지원을 제공하기 위해 진행됩니다. 공모를 통해 진행될 과제에서는 사용자 코드로는 계산이 불가능한 대규모 문제를 풀기 위해 단기적인 성능..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템의 SKL 사용 시 gromacs-2021.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온(SKL) OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2021.4 Version MPI IntelMPI 2021.4 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템의 KNL 사용 시 gromacs-2021.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온(KNL) OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250 컴파일러 Intel 2021.4 Version MPI IntelMPI 2021.4 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이..

1. SLURM 스케줄러의 Fairshare 스케줄링 정책 Fairshare는 모든 사람이 클러스터 시스템을 사용할 수 있는 공정한 기회를 얻게 해주는 스케줄링 정책입니다. 사용자의 시스템 사용량을 기반하여 Fairshare 점수를 계산해내고, 이 점수를 기반으로 대기 작업에 대한 할당의 우선순위가 정해집니다. 구체적으로, 시스템을 조금 더 많이 사용한 사용자에 비해 시스템을 사용하지 않은 사용자의 대기 작업이 더 높은 우선순위를 얻게 해줍니다. 2. 사용자별 Fairshare 값 확인 방법 $ slurm_fs_check User RawUsage FairShare ----------------------------------------------- testuser 2696014 0.835264 위 테이블..

1. oneAPI Base ToolKit - 특징 및 장점 1) oneAPI - Base Toolkit oneAPI와 인텔 oneAPI 툴킷은 함께 생산적이고 성능 기준에 맞는 이기종 프로그래밍을 개발자들에게 제공합니다. ㅇ 하드웨어의 가치를 모두 실현 최신 하드웨어의 모든 최첨단 기능을 도입하고 이용합니다. 예를 들어, AI 가속을 위한 인텔 딥러닝 부스트를 포함해 인텔 어드밴스드 익스텐션 512(인텔 AVX-512)를 지원하는 3세대 인텔 제온 스케일러블 프로세서를 최대한 활용할 수 있습니다. 또한 인텔 CPU, GPU, FPGA에서 성능을 극대화하여 가속 컴퓨팅을 충분히 활용할 수 있습니다. ㅇ 성능 기준에 맞는 코드를 빠르고 자신감 있게 개발 가능 아키텍처 간 라이브러리와 고급 도구 세트 전체를 ..

KISTI 국가슈퍼컴퓨팅센터는 초고성능컴퓨팅 (High Performance Computing, 이하 HPC) 육성법에 근거하여 국가 차원의 초고성능컴퓨팅을 자원을 지원하고 있습니다. 슈퍼컴퓨터 5호기 초고성능컴퓨팅 RnD 혁신지원 프로그램 3차(정기) 연구과제에 대해 아래와 같이 공모하오니, 희망 연구자는 마감일을 지켜 신청서를 제출해 주시기 바랍니다.. ㅇ 신청기간 - 2021년 11월 1일(월) ~ 2021년 11월 12일(금) 18:00 마감 ㅇ 지원분야 : 거대연구 및 창의연구 초고성능컴퓨터를 활용하여 계산과학, 제조혁신, 인공지능 등 연구개발을 수행하고자 하는 국내 재직 중인 박사급 이상 연구자 또는 이에 준하는 경력의 연구자(외국인의 경우 post doc.은 가능하나 방문 연구원은 제외) ㅇ..

KISTI 국가슈퍼컴퓨팅센터는 초고성능컴퓨팅 (High Performance Computing, 이하 HPC) 육성법에 근거하여 국가 차원의 초고성능컴퓨팅을 육성하고 있습니다. 국내 계산과학공학분야 연구자에게 연구지원 프로그램을 통해 초고성능컴퓨팅 자원을 무상으로 제공해 왔습니다. 2021년도 슈퍼컴퓨터 5호기 활용을 위한 초고성능컴퓨팅 기반 R&D 혁신지원 프로그램 2차 연구과제를 아래와 같이 공모하오니, 희망 연구자는 마감일을 지켜 신청서를 제출해 주시기 바랍니다. ㅇ 신청기간 - 2021년 7월 1일 ~ 2021년 7월 14일 ㅇ 신청방법 - 국가슈퍼컴퓨팅센터 홈페이지 '자원신청->R&D 혁신지원 프로그램->R&D 혁신지원 프로그램 신청'에서 신청(아래링크) https://www.ksc.re.kr/..