KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

Nurion [5호기] FAQ 모음 # 배치작업 (14) Q. 계산 노드에서 작업 실행은 어떻게 하나요? A. 계산 노드에서의 작업 실행은 작업 스케쥴러인 PBS를 통해 수행하실 수 있습니다. 작업에 따른 스크립트 예제는 홈폴더 ~/job_examples 에 있습니다. job_script를 작성하시고 qsub 명령을 통해 작업을 올리실 수 있습니다. $ qsub mpi.sh Q. 제출한 작업의 진행 상태를 알고 싶어요. A. 작업 상태를 알려주는 명령은 qstat 입니다. $ qstat - 내 작업만 확인하는 경우 $ qstat -u $USER - 작업ID 의 상세 정보 $ qstat -f {작업ID} Q. 사용할 수 있는 자원을 확인하는 방법은 어떻게 되나요? A. pbs_status 명령을 통해 현재..

안녕하세요? KISTI 슈퍼컴퓨터 5호기 누리온 사용자 지침서는 국가슈퍼컴퓨팅센터 웹사이트(https://www.ksc.re.kr/gsjw/jcs/hd)에서 확인가능합니다. 초보 사용자를 위한 동영상 지침서는 본 슈퍼컴퓨팅 블로그 "사용자 지침서/동영상 지침서 [초보사용자]" 카테고리에서 확인하실 수 있습니다. (동영상 지침서) 감사합니다.

데스트톱 가상화(VDI)는 Windows 환경에서 고성능 그래픽 처리 기능이 필요한 어플리케이션 실행을 위한 원격 데스크톱 서비스다. VDI는 누리온의 파일시스템과 연동되어 별도 파일 이동 없이 가상머신(VM)에서 공학해석 전·후처리가 가능하다. VM에서 해석(solving)은 지원되지 않으며, VM내에서 터미널 접속 프로그램(putty 등)을 통해 누리온 시스템으로 해석을 수행하면 된다. VM당 3.0Ghz 4코어 CPU, 32GB 메모리, 8GB GPU 메모리가 할당되어 있으며, 총 8개의 VM으로 구성되어 있다. 한정된 VM으로 다수의 사용자 지원을 위해 VM접속 상태에서 2시간 동안 사용하지 않는 경우 자동 로그오프 된다. 현재 공학해석 어플리케이션은 Abaqus 2020, Ansys 2020 R..

TSMSF를 이용한 데이터 아카이빙(Archiving) 방법 1. 시스템 환경 및 사용 신청 누리온은 사용자의 중요 파일 및 대용량 파일의 장기간(계약 만료 후 1년) 보관을 지원하기 위하여 10PBytes의 테이프(Tape) 라이브러리(IBM TS4500)를 운영합니다. TSMSF(Tiered Storage Management Script Facility)는 사용자의 데이터 백업 및 아카이빙을 지원하기 위한 소프트웨어로 누리온의 Datamover 노드에 설치되어 운영되고 있습니다. TSMSF는 사용자 데이터를 자동으로 아카이빙하고 사용자가 데이터를 필요로 할 때 수동으로 복원(restore)할 수 있도록 지원을 합니다. 이는 관리자에 의해 정기적으로 이루어지는 사용자 홈 디렉터리(/home01) 백업과..

본 문서는 누리온 시스템에서 i-PI 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, i-PI 소프트웨어 사용법과 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. i-PI 소개 - i-PI는 Python으로 작성된 Universal force engine 인터페이스입니다. - 원자간 상호작용에 대한 제일원리 평가 소프트웨어와 함께 사용하도록 설계되어 있습니다. - 본 문서는 i-PI와 LAMMPS를 같이 사용하는 경우에 대해 서술합니다. - LAMMPS 등 타 소프트웨어와 연동하여 계산을 수행하는 경우 상호..

가. Tensorflow에서 Horovod 사용법 다중노드에서 CPU를 활용할 경우 Horovod를 Tensorflow와 연동하여 병렬화가 가능하다. 아래 예시와 같이 Horovod 사용을 위한 코드를 추가해주면 Tensorflow와 연동이 가능하다. Tensorflow 및 Tensorflow에서 활용 가능한 Keras API 모두 Horovod와 연동이 가능하며 우선 Tensorflow에서 Horovod와 연동하는 방법을 소개한다. (예시: MNIST Dataset 및 LeNet-5 CNN 구조) ※ Tensorflow에서 Horovod 활용을 위한 자세한 사용법은 Horovod 공식 가이드 참조 (https://github.com/horovod/horovod#usage) ◦ Tensorflow에서 H..

본 문서는 누리온 시스템에서 가우시안 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, 가우시안 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 가우시안 소개 가우시안은 에너지, 분자구조 및 진동주파수를 예측하는 분자 모델링 패키지이며, 화학, 물리, 생명과학, 공학 분야 연구자를 위한 프로그램입니다. 자세한 사항은 가우시안 사의 홈페이지를 통해 얻을 수 있습니다. 홈페이지 주소: http://gaussian.com 2. 설치 버전 및 라이선스 - 설치 버전 : Rev.A03, Rev.B..

본 문서는 누리온 시스템에서 Q-Chem 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, Q-Chem 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. Q-Chem 소개 - Q-Chem은 분자구조, 반응성, 진동 및 NMR 스펙트럼 등을 예측하는 제일원리 양자 화학 패키지입니다. - Q-Chem v5에는 최신 고성능 DFT/HF 및 높은 수준의 post-HF 계산 방법을 제공합니다. - 자세한 사항은 Q-Chem 홈페이지를 방문하시기 바랍니다. (http://q-chem.com) 2. 소..

본 문서는 누리온 시스템에서 ABAQUS 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, ABAQUS 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 사용 정책 - 사용자별 최대 40개 CPU 코어 수행 가능합니다. - 한정된 라이선스를 슈퍼컴 사용자들이 함께 사용하므로, 사용정책 기준을 초과하여 사용할 경우 해당 작업은 관리자가 강제 종료 합니다. - 부득이하게 많은 라이선스가 필요할 경우, KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)를 통해 사전에 관리자와 협의해야..

본 문서는 누리온 시스템에서 OpenFOAM 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, OpenFOAM 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다.OpenFOAM 사용법에 대한 정보는 OpenFOAM 사이트(https://www.openfoam.com, https://openfoam.org, http://openfoamwiki.net)를 참고하시기 바랍니다. 1. 소프트웨어 설치 정보(1) 설치 버전 - 4.1(KNL, SKL), 5.0(KNL, SKL), 7.0(KNL, SKL),..

본 문서는 누리온 시스템에서 가우시안 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, 가우시안 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 가우시안 소개 가우시안은 에너지, 분자구조 및 진동주파수를 예측하는 분자 모델링 패키지이며, 화학, 물리, 생명과학, 공학 분야 연구자를 위한 프로그램입니다. 자세한 사항은 가우시안 사의 홈페이지를 통해 얻을 수 있습니다. 홈페이지 주소: http://gaussian.com 2. 설치 버전 및 라이선스 - KISTI 슈퍼컴퓨팅센터는 가우시안 16..

본 문서는 누리온 시스템에서 ANSYS FLUENT 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, ANSYS FLUENT 소프트웨어 사용법 및 5호기 시스템/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 사용 정책 - 사용자별 최대 40개 CPU 코어 수행 가능합니다. - 한정된 라이선스를 슈퍼컴 사용자들이 함께 사용하므로, 사용정책 기준을 초과하여 사용할 경우 해당 작업은 관리자가 강제 종료 합니다. - 부득이하게 많은 라이선스가 필요할 경우, KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)를 통해 사전에..

본 문서는 누리온 시스템에서 ANSYS CFX 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, ANSYS CFX 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 사용 정책 - 사용자별 최대 40개 CPU 코어 수행 가능합니다. - 한정된 라이선스를 슈퍼컴 사용자들이 함께 사용하므로, 사용정책 기준을 초과하여 사용할 경우 해당 작업은 관리자가 강제 종료 합니다. - 부득이하게 많은 라이선스가 필요할 경우, KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)를 통해 사전에 관리자..

본 문서는 누리온 시스템에서 NASTRAN 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, NASTRAN 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 사용 정책 - 사용자별 최대 40개 CPU 코어 수행 가능합니다. - 한정된 라이선스를 슈퍼컴 사용자들이 함께 사용하므로, 사용정책 기준을 초과하여 사용할 경우 해당 작업은 관리자가 강제 종료 합니다. - 부득이하게 많은 라이선스가 필요할 경우, KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)를 통해 사전에 관리자와 협의..

본 문서는 누리온 시스템에서 LS-DYNA 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다. 따라서, LS-DYNA 소프트웨어 사용법 및 누리온/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다. 누리온/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 누리온 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다. 1. 사용 정책 - 사용자별 최대 40개 CPU 코어 수행 가능합니다. - 한정된 라이선스를 슈퍼컴 사용자들이 함께 사용하므로, 사용정책 기준을 초과하여 사용할 경우 해당 작업은 관리자가 강제 종료 합니다. - 부득이하게 많은 라이선스가 필요할 경우, KISTI 홈페이지(https://www.ksc.re.kr)를 통해 사전에 관리자와 협의해..