뉴론 VASP 5.4.4 설치 (GPU 버전)

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 뉴론 시스템에 vasp 5.4.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 합니다.

1. 설치 환경

구분	내용
대상 시스템	뉴론
OS Version	리눅스 / CentOS 7.4
CPU	Intel Xeon E5-2670 v2
컴파일러	Intel 2018 Version
MPI	Mvapich2 2.3 Version
기타	Intel MKL Math Library, cuda 10.0

2. 설치 전 환경 설정

  뉴론 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 

  환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,

  이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용합니다.

[ 환경 설정 ]

$ module load intel/18.0.2 cuda/10.0 cudampi/mvapich2-2.3

3. vasp 5.4.4 버전 설치 과정

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고,

 소스 파일 다운로드 등은 생략합니다.  

설치 과정

$ tar xvzf vasp.5.4.4.tar.gz $ cd vasp.5.4.4 $ cp arch/makefile.include.linux_intel ./makefile.include $ vi makefile.include  - - - - - [ makefile.include 파일 수정 내용] 참고 $ make gpu

[make.include 파일 수정 내용]

# Precompiler options CPP_OPTIONS= -DHOST=\"LinuxIFC\"\              -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 \              -Duse_collective \              -DCACHE_SIZE=16000 \              -Davoidalloc \              -Duse_bse_te \              -Dtbdyn \              -Duse_shmem CPP        = fpp -f_com=no -free -w0  $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS) FC         = mpif90 FCL        = mpif90 -mkl -lstdc++ FREE       = -free -names lowercase FFLAGS     = -assume byterecl -w OFLAG      = -O2 -fPIC -xAVX OFLAG_IN   = $(OFLAG) DEBUG      = -O0 MKL_PATH   = $(MKLROOT)/lib/intel64 BLAS       = LAPACK     = OBJECTS    = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d.o INCS       =-I$(MKLROOT)/include/fftw LLIBS      =  OBJECTS_O1 += fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o OBJECTS_O2 += fft3dlib.o # For what used to be vasp.5.lib CPP_LIB    = $(CPP) FC_LIB     = $(FC) CC_LIB     = icc CFLAGS_LIB = -O FFLAGS_LIB = -O1 FREE_LIB   = $(FREE) OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o # For the parser library CXX_PARS   = icpc LIBS       += parser LLIBS      += -Lparser -lparser -lstdc++ # Normally no need to change this SRCDIR     = ../../src BINDIR     = ../../bin #================================================ # GPU Stuff CPP_GPU    = -DCUDA_GPU -DRPROMU_CPROJ_OVERLAP -DUSE_PINNED_MEMORY -DCUFFT_MIN=28 -UscaLAPACK OBJECTS_GPU = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d_gpu.o fftmpiw_gpu.o CC         = icc CXX        = icpc CFLAGS     = -fPIC -DADD_ -Wall -qopenmp -DMAGMA_WITH_MKL -DMAGMA_SETAFFINITY -DGPUSHMEM=300 -DHAVE_CUBLAS CUDA_ROOT  ?= /apps/cuda/10.0 NVCC       := $(CUDA_ROOT)/bin/nvcc -ccbin=icc -std=c++11 CUDA_LIB   := -L$(CUDA_ROOT)/lib64 -lnvToolsExt -lcudart -lcuda -lcufft -lcublas GENCODE_ARCH    := -gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \ -gencode=arch=compute_70,code=\"sm_70,compute_70\" MPI_INC    = /apps/compiler/intel/18.0.2/cudampi/10.0/mvapich2/2.3/include

4. 기타

vasp.5.4.4.18Apr17-6-g9f103f2a35 버전을 사용하는 경우 아래 참고 사이트를 확인하여 패치를 진행 해야 GPU 작업 오류가 발생하지 않습니다.

- 참고 : https://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/Installing_VASP