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누리온 RIP_46 설치 소개 본문

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누리온 RIP_46 설치 소개

슈퍼컴퓨팅인프라센터 2019. 1. 9. 10:53

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 RIP_46 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.


1. 설치 환경

 구분

내용

 대상 시스템

 누리온

OS Version 

 리눅스 / CentOS 7.3

 CPU

 Intel(R) Xeon(R) Gold 6126

 컴파일러

 Intel 2018.3 Version

 MPI

 

 기타

 


2. 설치 전 환경 설정

  누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 

  환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,

  이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.


[ 환경 설정 ]

 $ module load craype-x86-skylake intel/18.0.3 netcdf/4.6.1 ncl/6.5.0


3. 설치 과정

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고,
 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.  

 설치 과정

tar xvfz RIP_46.tar.gz

cd RIP_46

./configure 

 - - - - - [configure 과정 진행 내용] 참고

$ vi configure.rip

 - - - - - [configure.rip 파일 수정 수정 내용] 참고

./compile 


[configure 과정 진행 내용]

$ ./configure 

Will use NETCDF in dir: /apps/compiler/intel/18.0.3/applib1/x86-skylake/netcdf/4.6.1

------------------------------------------------------------------------

Please select from among the following supported platforms.


   1.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, PGI compiler

   2.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, g95 compiler

   3.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, gfortran compiler

   4.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, Intel compiler


Enter selection [1-4] : 4

------------------------------------------------------------------------

Configuration successful. To build the RIP4, type: compile 

------------------------------------------------------------------------

 

[configure.rip 파일 수정 수정 내용]

# configure.rip

#

# This file was automatically generated by the configure script in the

# top level directory. You may make changes to the settings in this

# file but be aware they will be overwritten each time you run configure.

# Ordinarily, it is necessary to run configure once, when the code is

# first installed.

#

# To permanently change options, change the settings for your platform

# in the file arch/configure.defaults, the preamble, and the postamble -

# then rerun configure.

#


.SUFFIXES: .F90 .f90 .F .f .c .o


SHELL          = /bin/sh


# Listing of options that are usually independent of machine type.

# When necessary, these are over-ridden by each architecture.


ARFLAGS


PERL = perl


RANLIB = echo


NETCDFLIB = -L${NETCDF}/lib -lnetcdff -lnetcdf 


NETCDFINC = -I${NETCDF}/include


NCARGLIBS = -L${NCARG_ROOT}/lib -lncarg -lcgm -lncarg_gks -lncarg_c -lX11 -lm \

           -L/apps/common/cairo/1.14.6/lib -lcairo \

           -L/apps/common/freetype/2.9.1/lib -lfreetype


#### Architecture specific settings ####


# Settings for PC Linux i486 i586 i686 x86_64, Intel compiler

#

FC      = ifort

FFLAGS  = -I. -convert big_endian -fPIC -xCOMMON-AVX512 -O2

CCFLAGS = -I. -DLITTLE -DUNDERSCORE -fPIC -xCOMMON-AVX512 -O2 -c

LDFLAGS

LOCAL_LIBS = -L/usr/lib64 -lX11 


###########################################################

#

# Macros, these should be generic for all machines


LN = ln -sf

MAKE = make -i -r

RM = /bin/rm -f

CP = /bin/cp

AR = ar ru


.IGNORE:

.SUFFIXES: .c .f90 .F90 .f .F .o


# There is probably no reason to modify these rules


.c.o:

$(RM) $@

$(CC) $(CCFLAGS) $(CFLAGS) -c $<


.f.o:

$(FC) $(FFLAGS) -c $*.f


.f90.o:

$(RM) $@ $*.mod

$(CP) $< $*.f

$(FC) $(FFLAGS) -c $*.f 

$(RM) $*.f


.F90.o:

$(RM) $@ $*.mod

$(CPP) $(CCFLAGS) $(FDEFS) $< > $*.f

$(FC) $(FFLAGS) -c $*.f ${NETCDF_INC}

$(RM) $*.f

※ 누리온 시스템 설치 예제는 SKL/KNL 계산노드에서 공통적으로 사용을 위해 "-xCOMMON-AVX512" 로 작성

 - SKL(skylake) 노드 전용 : -xCORE-AVX512

 - KNL(Intel Xeon Phi Knights Landing) 전용 : -xMIC-AVX512

 - SKL 과 KNL 공통 적용 : -xCOMMON-AVX512

 - 참고 :  https://software.intel.com/en-us/articles/compiling-for-the-intel-xeon-phi-processor-and-the-intel-avx-512-isa

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