누리온 VASP 5.3.5 설치

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 5.3.5 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.

1. 설치 환경

구분	내용
대상 시스템	누리온
OS Version	리눅스 / CentOS 7.3
CPU	Intel(R) Xeon(R) Gold 6148
컴파일러	Intel 2018.3 Version
MPI	IntelMPI 2018.3 Version
기타	Intel MKL Math Library

2. 설치 전 환경 설정

  누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 

  환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,

  이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.

[ 환경 설정 ]

$ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3

3. vasp 5.3.5 버전 설치 과정

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고,

 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.  

설치 과정

$ tar xvf vasp.5.lib.tar   $ tar xvf vasp.5.3.5.tar.gz   $ cd vasp.5.lib  $ cp makefile.linux_ifc_P4 makefile  $ vi makefile  - - - - - [vasp.5.lib makefile 파일 수정 내용] 참고  $ make  $ cd ../vasp.5.3  $ cp makefile.linux_ifc_P4 makefile  $ vi makefile  - - - - - [vasp.5.3 makefile 파일 수정 내용] 참고  $ make

[vasp.5.lib makefile 파일 수정 내용]

.SUFFIXES: .inc .f .F # C-preprocessor CPP     = gcc -E -P -C $*.F >$*.f FC=ifort CFLAGS = -O FFLAGS = -O0 -FI FREE   =  -FR DOBJ =  preclib.o timing_.o derrf_.o dclock_.o  diolib.o dlexlib.o drdatab.o #----------------------------------------------------------------------- # general rules #----------------------------------------------------------------------- libdmy.a: $(DOBJ) lapack_double.o linpack_double.o lapack_atlas.o         -rm libdmy.a         ar vq libdmy.a $(DOBJ) # files which do not require autodouble  lapack_min.o: lapack_min.f         $(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c lapack_min.f lapack_double.o: lapack_double.f         $(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c lapack_double.f lapack_single.o: lapack_single.f         $(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c lapack_single.f lapack_atlas.o: lapack_atlas.f         $(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c lapack_atlas.f linpack_double.o: linpack_double.f         $(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c linpack_double.f linpack_single.o: linpack_single.f         $(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c linpack_single.f .c.o:         $(CC) $(CFLAGS) -c $*.c .F.o:         $(CPP)          $(FC) $(FFLAGS) $(FREE) $(INCS) -c $*.f .F.f:         $(CPP)  .f.o:         $(FC) $(FFLAGS) $(FREE) $(INCS) -c $*.f

[vasp.5.3 makefile 파일 수정 내용]

.SUFFIXES: .inc .f .f90 .F SUFFIX=.f90 FC=mpiifort FCL=$(FC) CPP_=fpp -f_com=no -free -w0 $*.F $*$(SUFFIX) FFLAGS =  -FR -assume byterecl OFLAG=-O3 -ip -ftz -xCORE-AVX2 OFLAG_HIGH = $(OFLAG) OBJ_HIGH = OBJ_NOOPT = DEBUG  = -FR -O0 INLINE = $(OFLAG) MKL_PATH=$(MKLROOT)/lib/intel64 BLAS= -mkl=cluster BLACS =  SCALAPACK =  CPP= $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \  -DCACHE_SIZE=16000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \  -DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \  -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV LIB  = -L../vasp.5.lib -ldmy \      ../vasp.5.lib/linpack_double.o \      $(BLAS) $(SCALAPACK) LINK = -shared-intel INCS= -I$(MKLROOT)/include/fftw FFT3D= fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o \        $(MKLROOT)/lib/intel64/libfftw3xf_intel.a BASIC=   symmetry.o symlib.o   lattlib.o  random.o SOURCE=  base.o     mpi.o      smart_allocate.o      xml.o  \          constant.o jacobi.o   main_mpi.o  scala.o   \          asa.o      lattice.o  poscar.o   ini.o  mgrid.o  xclib.o  vdw_nl.o  xclib_grad.o \          radial.o   pseudo.o   gridq.o     ebs.o  \          mkpoints.o wave.o     wave_mpi.o  wave_high.o  spinsym.o \          $(BASIC)   nonl.o     nonlr.o    nonl_high.o dfast.o    choleski2.o \          mix.o      hamil.o    xcgrad.o   xcspin.o    potex1.o   potex2.o  \          constrmag.o cl_shift.o relativistic.o LDApU.o \          paw_base.o metagga.o  egrad.o    pawsym.o   pawfock.o  pawlhf.o   rhfatm.o  hyperfine.o paw.o   \          mkpoints_full.o       charge.o   Lebedev-Laikov.o  stockholder.o dipol.o    pot.o \          dos.o      elf.o      tet.o      tetweight.o hamil_rot.o \          chain.o    dyna.o     k-proj.o    sphpro.o    us.o  core_rel.o \          aedens.o   wavpre.o   wavpre_noio.o broyden.o \          dynbr.o    hamil_high.o  rmm-diis.o reader.o   writer.o   tutor.o xml_writer.o \          brent.o    stufak.o   fileio.o   opergrid.o stepver.o  \          chgloc.o   fast_aug.o fock_multipole.o  fock.o  mkpoints_change.o sym_grad.o \          mymath.o   internals.o npt_dynamics.o   dynconstr.o dimer_heyden.o dvvtrajectory.o subdftd3.o \          vdwforcefield.o nmr.o      pead.o     subrot.o   subrot_scf.o  paircorrection.o \          force.o    pwlhf.o    gw_model.o optreal.o  steep.o    davidson.o  david_inner.o \          electron.o rot.o  electron_all.o shm.o    pardens.o  \          optics.o   constr_cell_relax.o   stm.o    finite_diff.o elpol.o    \          hamil_lr.o rmm-diis_lr.o  subrot_cluster.o subrot_lr.o \          lr_helper.o hamil_lrf.o   elinear_response.o ilinear_response.o \          linear_optics.o \          setlocalpp.o  wannier.o electron_OEP.o electron_lhf.o twoelectron4o.o \          gauss_quad.o m_unirnk.o minimax_tabs.o minimax.o \          mlwf.o     ratpol.o screened_2e.o wave_cacher.o chi_base.o wpot.o \          local_field.o ump2.o ump2kpar.o fcidump.o ump2no.o \          bse_te.o bse.o acfdt.o chi.o sydmat.o \          lcao_bare.o wnpr.o dmft.o \          rmm-diis_mlr.o  linear_response_NMR.o wannier_interpol.o linear_response.o  auger.o getshmem.o \          dmatrix.o vasp: $(SOURCE) $(FFT3D) $(INC) main.o         rm -f vasp         $(FCL) -o vasp main.o  $(SOURCE)   $(FFT3D) $(LIB) $(LINK) makeparam: $(SOURCE) $(FFT3D) makeparam.o main.F $(INC)         $(FCL) -o makeparam  $(LINK) makeparam.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB) zgemmtest: zgemmtest.o base.o random.o $(INC)         $(FCL) -o zgemmtest $(LINK) zgemmtest.o random.o base.o $(LIB) dgemmtest: dgemmtest.o base.o random.o $(INC)         $(FCL) -o dgemmtest $(LINK) dgemmtest.o random.o base.o $(LIB)  ffttest: base.o smart_allocate.o mpi.o mgrid.o random.o ffttest.o $(FFT3D) $(INC)         $(FCL) -o ffttest $(LINK) ffttest.o mpi.o mgrid.o random.o smart_allocate.o base.o $(FFT3D) $(LIB) kpoints: $(SOURCE) $(FFT3D) makekpoints.o main.F $(INC)         $(FCL) -o kpoints $(LINK) makekpoints.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB) clean:           -rm -f *.g *.f90 *.o *.L *.mod ; touch *.F main.o: main$(SUFFIX)         $(FC) $(FFLAGS) $(DEBUG)  $(INCS) -c main$(SUFFIX) xcgrad.o: xcgrad$(SUFFIX)         $(FC) $(FFLAGS) $(INLINE)  $(INCS) -c xcgrad$(SUFFIX) xcspin.o: xcspin$(SUFFIX)         $(FC) $(FFLAGS) $(INLINE)  $(INCS) -c xcspin$(SUFFIX) makeparam.o: makeparam$(SUFFIX)         $(FC) $(FFLAGS) $(DEBUG)  $(INCS) -c makeparam$(SUFFIX) makeparam$(SUFFIX): makeparam.F main.F base.o: base.inc base.F mgrid.o: mgrid.inc mgrid.F constant.o: constant.inc constant.F lattice.o: lattice.inc lattice.F setex.o: setexm.inc setex.F pseudo.o: pseudo.inc pseudo.F mkpoints.o: mkpoints.inc mkpoints.F wave.o: wave.F nonl.o: nonl.inc nonl.F nonlr.o: nonlr.inc nonlr.F $(OBJ_HIGH):         $(CPP)         $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG_HIGH) $(INCS) -c $*$(SUFFIX) $(OBJ_NOOPT):         $(CPP)         $(FC) $(FFLAGS) $(INCS) -c $*$(SUFFIX) fft3dlib_f77.o: fft3dlib_f77.F         $(CPP)         $(F77) $(FFLAGS_F77) -c $*$(SUFFIX) .F.o:         $(CPP)         $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX) .F$(SUFFIX):         $(CPP) $(SUFFIX).o:         $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX) # special rules #----------------------------------------------------------------------- # these special rules have been tested for ifc.11 and ifc.12 only fft3dlib.o : fft3dlib.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX) fft3dfurth.o : fft3dfurth.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) fftw3d.o : fftw3d.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O1 $(INCS) -c $*$(SUFFIX) fftmpi.o : fftmpi.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) fftmpiw.o : fftmpiw.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O1 $(INCS) -c $*$(SUFFIX) wave_high.o : wave_high.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) # the following rules are probably no longer required (-O3 seems to work) wave.o : wave.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX) paw.o : paw.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) cl_shift.o : cl_shift.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX) us.o : us.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) LDApU.o : LDApU.F         $(CPP)         $(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX)