KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

[오류 내용]Program Exception - illegal instruction [원인]CPU에 최적화된 옵션을 사용한 프로그램이 다른 타입의 CPU 에서 실행 하는 경우 발생합니다. [조치사항]사용할 CPU 타입에 맞게 프로그램을 재 컴파일을 진행 해야 합니다.각 컴파일러 별 CPU 타입에 맞는 최적화 옵션은 아래 참고 사항을 확인해 주세요.※ 참고 : http://blog.ksc.re.kr/101

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 5.3.5 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2018.3 Version MPI IntelMPI 2018.3 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 ..

vasp.5.4.4.18Apr17 버전은 버그가 있어 패치가 필요한것으로 알려져 있다.아래 내용들을 참고 하여 vasp 설치 전 패치를 진행해야 오류가 발생하지 않는다. [참고 주소]- vasp site : https://www.vasp.at/index.php/news/archive- vasp wiki site : http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/Installing_VASP [패치 파일 목록]vasp download portal 또는 vasp wiki 에서 다운 로드 가능.- patch.5.4.4.16052018.gz [패치 방법]각 압축 파일을 Gunzip 후 vasp.5.4.4 root directory 에서 패치 진행(압축해제 방법은 생략한다)$ patc..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 장비에 RASPA-2.0 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 설치 과정 소개는 zip 을 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2018.3 version MPI IntelMPI 2018.3 version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules(http://modu..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 gcc-8.1.0 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 GCC 4.8.5 (CentOS 7.3 default compiler) MPI 기타 2. 설치 전 환경 설정 gcc-8.1.0 버전 설치에 필요한 gmp, mpfr, mpc는 누리온 시스템에 미리 설치된 /apps/common 라이브러리들을 사용한다. 만약 다른 버전의 gmp, mpfr, mpc 가 필요한 경우는 사용자의 홈 디렉토리(/home01/$USER)에 설치 후 환경설정을 해서 사용하면 된다. [ 환경 설정 ] $ expo..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 gromacs-5.1.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2018.3 Version MPI IntelMPI 2018.3 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ ..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 누리온 시스템에 siesta-4.1-b3 source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템누리온 OS Version리눅스 / CentOS 7.3 CPUIntel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러Intel 2017.5 Version MPIIntelMPI 2017.5 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설..

안녕하십니까? 슈퍼컴퓨팅본부입니다. 지난 3차 베타서비스에 이어 V100 GPU 9대를 추가한 KAT시스템을 아래와 같이 4차 베타서비스 합니다. GPU 컴퓨팅 및 최신 아키텍쳐의 CPU사용에 관심 있는 사용자분들께서는 사용신청해주시기 바랍니다. 1. 베타서비스 기간 2018년 12월 10일~2019년 2월 9일 (2개월간, 추후 변경가능) 2. 대상 GPU 활용이 필요한 연구 주제를 보유한 연구자 3. 신청기간 2018년 11월 21일 ~ 2018년 11월 29일까지 4. 신청방법 연구지원프로그램 신청시스템 ( https://enables.ksc.re.kr )을 통해 신청 5. 시스템 사양 계산노드 - 총 42노드 - single K40 GPU 8노드 (노드당 K40카드 한장) - dual V100 G..

각 컴파일러들에서 INTEL AVX-512(Advanced Vector Extensions 512) 를 활성화 시키는 옵션입니다.INTEL AVX-512 참고 : https://en.wikipedia.org/wiki/AVX-512 [GNU]- Skylake : -march=skylake-avx512- KNL : -march=knl [Intel]- Skylake : -xCORE-AVX512- KNL : -xMIC-AVX512※ 참고 : https://software.intel.com/en-us/articles/compiling-for-the-intel-xeon-phi-processor-and-the-intel-avx-512-isa [PGI]- Skylake : -tp=skylake- KNL : -tp=kn..

[오류 내용]/bin/sh^M: bad interpreter: No such file or directory [원인]dos 형식의 파일에서의 새줄 문자와 Unix 형식에서의 새줄 문자가 달라 ^M을 명령으로 인식해서 생기는 문제입니다. [조치사항]dos 포멧으로 작성된 파일을 vi를 이용해 ^M을 제거 하거나 dos2unix 명령어를 이용하여 Unix 파일 포멧으로 변경해주어야 합니다. [예제]dos2unix {파일명} - 참고 : https://ko.wikipedia.org/wiki/새줄_문자

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 5.4.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2018.3 Version MPI IntelMPI 2018.3 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ 환경 ..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 5.4.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250 컴파일러 Intel 2018.3 Version MPI IntelMPI 2018.3 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [..

KISTI 국가슈퍼컴퓨팅본부는 5호기 베타서비스 기간중에 버스터버퍼(Burst Buffer) 시스템을 사용할 응응프로그램을 모집합니다. 버스터버퍼는 데이터 입출력(I/O)이 많은 워크로드를 대응하기 위해 도입된 스토리지며, 5호기에 설치된 전역 파일시스템(Global Filesystem) 대비 약 2.6배 정도 넓은 대역폭을 제공합니다. 선정된 사용자에 대해서는 5호기 계산자원 및 버스터버퍼 스토리지를 사용해볼 수 있는 기회가 주어집니다. 다만, 선정 후 전역 파일시스템 대비 버스터버퍼에 대한 간단한 성능 리포트를 제출해야합니다. * 참고로 버스터버퍼는 DDN(Data Direct Network)사의 IME(Infinite Memory Engine) 솔루션을 사용하며, NVMe 기반의 SSD로 구축되어 ..

안녕하세요? KISTI 국가슈퍼컴퓨팅본부는 5호기 베타서비스 기간중에 버스터버퍼(Burst Buffer) 시스템을 사용할 응응프로그램을 모집합니다. 버스터버퍼는 데이터 입출력(I/O)이 많은 워크로드를 대응하기 위해 도입된 스토리지며, 5호기에 설치된 전역 파일시스템(Global Filesystem) 대비 약 2.6배 정도 넓은 대역폭을 제공합니다. 선정된 사용자에 대해서는 5호기 계산자원 및 버스터버퍼 스토리지를 사용해볼 수 있는 기회가 주어집니다. 다만, 선정 후 전역 파일시스템 대비 버스터버퍼에 대한 간단한 성능 리포트를 제출해야합니다. * 참고로 버스터버퍼는 DDN(Data Direct Network)사의 IME(Infinite Memory Engine) 솔루션을 사용하며, NVMe 기반의 SSD..

안녕하십니까? KISTI (한국과학기술정보연구원)은 슈퍼컴퓨터 5호기 '누리온' 도입을 앞두고, 사용자 교육 및 저변 확대를 위해 9월 19일부터 9월 21일까지 슈퍼컴퓨터 5호기 사용자 워크숍을 아래와 같이 개최합니다. * 강의 주제 : Intel Xeon Phi(KNL) 프로그래밍 * 신청 기간 : 2018.09.10 ~ 2018.09.18 * 수강 인원 : 30명 (선착순 마감) * 교육 장소 : KISTI 슈퍼컴퓨팅교육실 (별관 1층) * 신청 방법 - KISTI 교육 신청 사이트 (https://webedu.ksc.re.kr) -> 교육센터 -> 센터교육 -> 교육신청 * 강의 일정 ※ 별도 준비물 없음 (교재 및 실습환경 제공)