KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

다음은 KISTI 뉴론 시스템의 AMD 노드와 Cascade 노드의 CPU 만을 활용한 application 간 성능을 보여주는 예제이다. 1. 개요 비교 노드 cas_v100_2 amd core 수 1, 10, 20, 40 1, 10, 20, 40, 64 컴파일러 GNU, intel MPI OpenMPI, impi 라이브러리 fftw3_single, fftw3_double, MKL applications NAMD, GROMACS, OpenFOAM 2. applications 별 성능 분석 1) NAMD 단일 코어 단순 컴파일러 기준 gcc 는 AMD 노드에서 보다 좋은 성능을 보여줌 단순 컴파일러 기준 intel 은 Cascade 노드에서 보다 좋은 성능을 보여줌 2) NAMD 멀티 코어 gcc 의 경..

AMD Instinct MI100은 AMD CDNA 아키텍처를 기반으로 설계된 GPU로 HPC와 AI를 모두 지원하도록 설계되어 있다. 일반 연산을 위한 Stream Processor (FP64: 11.5TFLOPs, FP32 23.1 TFLOPs) 및 FP32, F16 matrix (46.1TFLOPs, 184.6 TFLOPs) 가속을 위한 Matrix Core 두가지로 나뉘어 설계되어 있다. HBM2 32GB를 GPU 메모리로 사용하며 PCIe 4.0까지 지원하며 Infinity Fabric Link로 GPU 간 통신이 가능하나 테스트 보드 설계의 한계로 인해 본 성능 테스트에서는 PCIe 3.0을 활용하였다. NVIDIA GPU와 비교하였을 때 AMD GPU의 가장 큰 차이점은 warp에 해당하는 ..

1. Checkpoint 기능의 정의 모종의 이유로 계산이 완료되기 전에 중단되었을 때(walltime limit 초과 및 에러 발생 등) 계산을 특정 지점부터 이어서 수행할 수 있도록 작업의 상태를 주기적으로 저장하는 기능 2. Checkpoint 기능 관련 문서 Checkpoint 기능의 명칭이나(Autosave 등) 활성화 여부는 애플리케이션의 종류 및 버전에 따라 다를 수 있으며, 일부 애플리케이션의 경우 수동으로 활성화해야 할 수도 있다. Checkpoint 기능 관련 세부 사항은 다음과 같은 기술 문서를 통해 확인할 수 있다. 1) Abaqus - Abaqus execution (abaqus-docs.mit.edu/2017/English/SIMACAEEXCRefMap/simaexc-c-anal..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 장비에 Quantum Espresso-6.6 source 버전으로 설치하는 방법에 대하여 소개한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온 OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6126 컴파일러 Intel 2019.0.5 Version MPI IntelMPI 2019.0.5 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개에서는 module load..

슈퍼컴퓨팅본부에서는 KISTI 슈퍼컴퓨터 사용자지원 정책에 따라 계산과학/공학 분야의 연구를 위해 대규모 병렬 계산 또는 첨단 계산 기법을 필요로 하는 슈퍼컴퓨터 사용자들을 지원하고 있음. 올해는 NVIDIA와 함께 GPU기반 최적 병렬화와 AI 관련 연구협력 프로그램을 시작합니다. 지원의 일환으로 사용자들이 슈퍼컴퓨터를 이용하여 문제 해결에 필요한 시간을 단축하거나, 현재보다 훨씬 더 큰 규모의 문제에 도전하는 등 보다 높은 연구 생산성을 얻을 수 있도록 성능최적화 및 병렬화를 지원합니다. 이를 위해 기존 연구를 계산 규모나 성능 측면에서 큰 폭으로 확장할 수 있는 주제를 발굴하고 지원을 제공하기 위해 진행합니다. GPU 최적병렬화(성능최적화 및 병렬화)란? 슈퍼컴퓨터들은 대규모 병렬 구조로, 동시에 ..