KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

슈퍼컴퓨팅본부에서는 KISTI 슈퍼컴퓨터 사용자지원 정책에 따라 계산과학/공학 분야의 연구를 위해 대규모 병렬 계산 또는 첨단 계산 기법을 필요로 하는 슈퍼컴퓨터 사용자들을 지원하고 있습니다. 올해는 NVIDIA와 함께 GPU기반 최적 병렬화와 AI 관련 연구협력 프로그램을 시작합니다. 지원의 일환으로 사용자들이 슈퍼컴퓨터를 이용하여 문제 해결에 필요한 시간을 단축하거나, 현재보다 훨씬 더 큰 규모의 문제에 도전하는 등 보다 높은 연구 생산성을 얻을 수 있도록 성능최적화 및 병렬화를 지원합니다. 당면한 문제해결에 국한된 단기적인 성능최적화지원을 뛰어넘어 중·장기적인 지원을 통해 기존 연구 주제를 계산 규모나 성능 측면에서 큰 폭으로 확장할 수 있는 주제를 발굴하고 지원을 제공하기 위해 진행됩니다. 1. ..

슈퍼컴퓨팅본부에서는 KISTI 슈퍼컴퓨터 사용자지원 정책에 따라 계산과학/공학 분야의 연구를 위해 대규모 병렬 계산 또는 첨단 계산 기법을 필요로 하는 슈퍼컴퓨터 사용자들을 지원하고 있습니다. 지원의 일환으로 사용자들이 슈퍼컴퓨터를 이용하여 문제 해결에 필요한 시간을 단축하거나, 현재보다 훨씬 더 큰 규모의 문제에 도전하는 등 보다 높은 연구 생산성을 얻을 수 있도록 성능최적화 및 병렬화를 지원합니다. 당면한 문제해결에 국한된 단기적인 성능최적화지원을 뛰어넘어 중·장기적인 지원을 통해 기존 연구 주제를 계산 규모나 성능 측면에서 큰 폭으로 확장할 수 있는 주제를 발굴하고 지원을 제공하기 위해 진행됩니다. 공모를 통해 진행될 과제에서는 사용자 코드로는 계산이 불가능한 대규모 문제를 풀기 위해 단기적인 성능..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템의 SKL 사용 시 gromacs-2021.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온(SKL) OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2021.4 Version MPI IntelMPI 2021.4 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템의 KNL 사용 시 gromacs-2021.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분 내용 대상 시스템 누리온(KNL) OS Version 리눅스 / CentOS 7.7 CPU Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250 컴파일러 Intel 2021.4 Version MPI IntelMPI 2021.4 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이..

1. SLURM 스케줄러의 Fairshare 스케줄링 정책 Fairshare는 모든 사람이 클러스터 시스템을 사용할 수 있는 공정한 기회를 얻게 해주는 스케줄링 정책입니다. 사용자의 시스템 사용량을 기반하여 Fairshare 점수를 계산해내고, 이 점수를 기반으로 대기 작업에 대한 할당의 우선순위가 정해집니다. 구체적으로, 시스템을 조금 더 많이 사용한 사용자에 비해 시스템을 사용하지 않은 사용자의 대기 작업이 더 높은 우선순위를 얻게 해줍니다. 2. 사용자별 Fairshare 값 확인 방법 $ slurm_fs_check User RawUsage FairShare ----------------------------------------------- testuser 2696014 0.835264 위 테이블..