KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터에서 무료로 진행하는 2017년도 하반기 슈퍼컴퓨팅교육 일정을 알려드립니다. 각 교육에 대한 세부 정보 및 접수현황 등은 아래 사이트에서 확인하실 수 있습니다. 참고로 아래 소개하는 모든 교육은 KISTI 슈퍼컴퓨팅센터 교육실 (대전)에서 이루어집니다. 교육센터 홈페이지: http://webedu.ksc.re.kr/ 2 0 1 7 7월 강의명 교육날짜 기간 Tachyon2 시스템 활용 2017.07.7(금) 1일 Fortran 2017.07.20(목) ~ 2017.07.21(금) 2일 2 0 1 7 8월 강의명 교육날짜 기간 OpenMP 초급/중급 2017.08.10(목) ~ 2017.08.11(금) 2일 MPI 초급/중급 2017.08.24(목) ~ 2017.08.25(금) 2일..

이 문서는 Intel Xeon Phi KNL (Knights Landing)이 장착되어 있는 머신에서 NAMD 2.12이 수행될 수 있도록 소스 버전을 빌드하는 방법에 대해 기술한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템워크스테이션 OS Version리눅스 / CentOS 7.2 CPUIntel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7210 @ 1.30GHz (64-core) 컴파일러Intel Compiler 2017 기타 Intel MKL 2. 설치 과정 NAMD 소스 파일 압축 풀기 $ tar xzf NAMD_2.12_Source.tar.gz $ cd NAMD_2.12_Source 2.1 charm 빌드NAMD 소스는 charm을 이용하여 빌드한다. charm은 NAMD 소스내에 tar파일 형태로 포함..

vasp.5.4.1.24Jun15 버전은 버그가 있어 패치가 필요한것으로 알려져 있다.아래 내용들을 참고 하여 vasp 설치 전 패치를 진행해야 오류가 발생하지 않는다. [참고 주소]- vasp site : https://www.vasp.at/index.php/news/archive- vasp wiki site : http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/Installing_VASP [패치 파일 목록]vasp download portal 또는 vasp wiki 에서 다운 로드 가능.- patch.5.4.1.08072015.gz- patch.5.4.1.27082015.gz- patch.5.4.1.06112015.gz [패치 방법]각 압축 파일을 Gunzip 후 vasp...

OpenMP 병렬 프로그래밍을 지원하는 Open Source 프로그램을 Intel 컴파일러로 설치해서사용하고자 할때 configure 단계에서 OpenMP 체크 시 오류가 발생할 경우 [오류내용]checking how to enable OpenMP... unknownconfigure: error: don't know how to enable OpenMP [원인]Intel 컴파일러에서 OpenMP 활성화 옵션이 "-qopenmp" 이지만 일부 Open Source 들에서 "-mp" 로만 지정되어 있어 오류 발생 [해결방법]파일 편집기(vi)로 configure 파일을 열어서 CFLAGS와 같은 환경변수에 "-mp" 로 지정된 부분을 "-qopenmp"로 수정해 준다 [예제 : fftw-2.1.5]변경 전 ..

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터에서는 2017년 5월 10일부터 24일까지 제 2차 HPC 응용연구지원프로그램 응용과제 공모 신청을 받습니다. 이번 지원 규모는 다음과 같습니다. 신규연구/창의연구분야: 약 2,700만 CPU 시간 (타키온2 시스템), 80만 CPU 시간 (신바람 시스템) 도전연구분야 : 약 1,000만 시간 (타키온2 시스템, 최대 4,096코어를 3개월 동안 전용 노드 형태로 지원 가능)신청 자격은 국내 재직 중인 박사급 연구자 또는 이에 준하는 경험을 가진 연구자 (외국인은 post doc./방문연구원은 제외)이며, 그 밖의 자세한 내용은 아래 포스터를 참고해 주시기 바랍니다. 감사합니다.