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누리온 VASP 6.1.0 설치 소개 본문

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누리온 VASP 6.1.0 설치 소개

슈퍼컴퓨팅인프라센터 2020. 4. 23. 10:47

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 6.1.0 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.


1. 설치 환경

 구분

내용

 대상 시스템

 누리온

OS Version 

 리눅스 / CentOS 7.7

 CPU

 Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250

 컴파일러

 Intel 2018.3 Version

 MPI

 IntelMPI 2018.3 Version

 기타

 Intel MKL Math Library


2. 설치 전 환경 설정

  누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 

  환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,

  이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.


[ 환경 설정 ]

 $ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3


3. vasp 6.1.0 버전 설치 과정

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고,
 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.  

 설치 과정

tar xvzf vasp.6.1.0.tar.gz

$ cd vasp.6.1.0

$ vi makefile

 - - - - - [ makefile 파일 수정 내용] 참고 - - - - - 


cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include

$ vi makefile.include

 - - - - - [ makefile.include 파일 수정 내용] 참고 - - - - - 


$ make all



[makefile 파일 수정 내용]

<수정 전>

VERSIONS = std gam ncl gpu gpu_ncl


<수정 후>
VERSIONS = std gam ncl



[makefile.include 파일 수정 내용]

ADDITIONAL_OPTS=-O3 -qopenmp -xCOMMON-AVX512 -align array64byte

ADDITIONAL_OPTS_CC=-O3 -qopenmp -xCOMMON-AVX512


# Precompiler options

CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC15_impi\" \

-DCACHE_SIZE=12000 -Davoidalloc \

-DMPI_BLOCK=8000  -Duse_collective \

-DnoAugXCmeta -Duse_bse_te \

-Dtbdyn \

-D_OPENMP -DPROFILING -Duse_shmem \

-Dshmem_bcast_buffer -Dsheme_rproj

CPP = fpp -f_com=no -free -w0 $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)

FC = mpiifort -mkl=parallel ${ADDITIONAL_OPTS}

FCL = mpiifort -mkl=parallel ${ADDITIONAL_OPTS}

FREE = -free -names lowercase

FFLAGS = -assume byterecl

OFLAG = ${ADDITIONAL_OPTS}

OFLAG_IN = $(OFLAG)

DEBUG = -O0

MKL_PATH = $(MKLROOT)/lib/intel64

BLAS =

LAPACK =

BLACS = 

SCALAPACK = 

OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o

INCS =-I$(MKLROOT)/include/fftw

LLIBS = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS)

OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o

OBJECTS_O2 += fft3dlib.o


# For what used to be vasp.5.lib

CPP_LIB = $(CPP)

FC_LIB = $(FC)

CC_LIB = icc

CFLAGS_LIB = -O

FFLAGS_LIB = ${ADDITIONAL_OPTS}

FREE_LIB = $(FREE)

OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o


# For the parser library

CXX_PARS = icpc

LIBS += parser

LLIBS += -Lparser -lparser -lstdc++


# # Normally no need to change this

SRCDIR = ../../src

BINDIR = ../../bin


#================================================

# GPU Stuff


CPP_GPU    = -DCUDA_GPU -DRPROMU_CPROJ_OVERLAP -DUSE_PINNED_MEMORY -DCUFFT_MIN=28 -UscaLAPACK


OBJECTS_GPU = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d_gpu.o fftmpiw_gpu.o


CC         = icc

CXX        = icpc

CFLAGS     = -fPIC -DADD_ -Wall -openmp -DMAGMA_WITH_MKL -DMAGMA_SETAFFINITY -DGPUSHMEM=300 -DHAVE_CUBLAS


CUDA_ROOT  ?= /usr/local/cuda/

NVCC       := $(CUDA_ROOT)/bin/nvcc -ccbin=icc

CUDA_LIB   := -L$(CUDA_ROOT)/lib64 -lnvToolsExt -lcudart -lcuda -lcufft -lcublas


GENCODE_ARCH    := -gencode=arch=compute_30,code=\"sm_30,compute_30\" \

                   -gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \

                   -gencode=arch=compute_60,code=\"sm_60,compute_60\"


MPI_INC    = $(I_MPI_ROOT)/include64/



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