일 | 월 | 화 | 수 | 목 | 금 | 토 |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | |||||
3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 |
17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 |
24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 |
- TACHYON2
- 타키온2
- GROMACS
- 신바람
- abaqus
- 가우시안
- Kat
- cuda
- 슈퍼컴퓨팅
- 슈퍼컴퓨터
- GPU
- 뉴론
- nurion
- ansys
- Gaussian
- KNL
- 누리온
- Linux
- 슈퍼컴퓨팅교육
- 국가슈퍼컴퓨팅센터
- openfoam
- vasp
- skl
- SGE
- 5호기
- G16
- KISTI
- HPC
- sinbaram
- neuron
- Today
- Total
KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그
누리온 VASP 6.1.0 설치 소개 본문
KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 6.1.0 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.
1. 설치 환경
구분 | 내용 |
대상 시스템 | 누리온 |
OS Version | 리눅스 / CentOS 7.7 |
CPU | Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250 |
컴파일러 | Intel 2018.3 Version |
MPI | IntelMPI 2018.3 Version |
기타 | Intel MKL Math Library |
2. 설치 전 환경 설정
누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여
환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,
이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.
[ 환경 설정 ]
$ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3 |
3. vasp 6.1.0 버전 설치 과정
설치 과정 |
$ tar xvzf vasp.6.1.0.tar.gz $ cd vasp.6.1.0 $ vi makefile - - - - - [ makefile 파일 수정 내용] 참고 - - - - - $ cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include $ vi makefile.include - - - - - [ makefile.include 파일 수정 내용] 참고 - - - - - $ make all |
[makefile 파일 수정 내용]
<수정 전> VERSIONS = std gam ncl gpu gpu_ncl <수정 후> VERSIONS = std gam ncl |
[makefile.include 파일 수정 내용]
ADDITIONAL_OPTS=-O3 -qopenmp -xCOMMON-AVX512 -align array64byte ADDITIONAL_OPTS_CC=-O3 -qopenmp -xCOMMON-AVX512 # Precompiler options CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC15_impi\" \ -DCACHE_SIZE=12000 -Davoidalloc \ -DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \ -DnoAugXCmeta -Duse_bse_te \ -Dtbdyn \ -D_OPENMP -DPROFILING -Duse_shmem \ -Dshmem_bcast_buffer -Dsheme_rproj CPP = fpp -f_com=no -free -w0 $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS) FC = mpiifort -mkl=parallel ${ADDITIONAL_OPTS} FCL = mpiifort -mkl=parallel ${ADDITIONAL_OPTS} FREE = -free -names lowercase FFLAGS = -assume byterecl OFLAG = ${ADDITIONAL_OPTS} OFLAG_IN = $(OFLAG) DEBUG = -O0 MKL_PATH = $(MKLROOT)/lib/intel64 BLAS = LAPACK = BLACS = SCALAPACK = OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o INCS =-I$(MKLROOT)/include/fftw LLIBS = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS) OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o OBJECTS_O2 += fft3dlib.o # For what used to be vasp.5.lib CPP_LIB = $(CPP) FC_LIB = $(FC) CC_LIB = icc CFLAGS_LIB = -O FFLAGS_LIB = ${ADDITIONAL_OPTS} FREE_LIB = $(FREE) OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o # For the parser library CXX_PARS = icpc LIBS += parser LLIBS += -Lparser -lparser -lstdc++ # # Normally no need to change this SRCDIR = ../../src BINDIR = ../../bin #================================================ # GPU Stuff CPP_GPU = -DCUDA_GPU -DRPROMU_CPROJ_OVERLAP -DUSE_PINNED_MEMORY -DCUFFT_MIN=28 -UscaLAPACK OBJECTS_GPU = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d_gpu.o fftmpiw_gpu.o CC = icc CXX = icpc CFLAGS = -fPIC -DADD_ -Wall -openmp -DMAGMA_WITH_MKL -DMAGMA_SETAFFINITY -DGPUSHMEM=300 -DHAVE_CUBLAS CUDA_ROOT ?= /usr/local/cuda/ NVCC := $(CUDA_ROOT)/bin/nvcc -ccbin=icc CUDA_LIB := -L$(CUDA_ROOT)/lib64 -lnvToolsExt -lcudart -lcuda -lcufft -lcublas GENCODE_ARCH := -gencode=arch=compute_30,code=\"sm_30,compute_30\" \ -gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \ -gencode=arch=compute_60,code=\"sm_60,compute_60\" MPI_INC = $(I_MPI_ROOT)/include64/ |
'SW 설치 문서 창고 > 누리온(NURION)' 카테고리의 다른 글
누리온 GROMACS-2020.2 버전 설치 소개 (KNL) (0) | 2020.06.26 |
---|---|
누리온 GROMACS-2020.2 버전 설치 소개 (SKL) (0) | 2020.06.26 |
누리온 v_sim-3.7.2 설치 소개 (0) | 2020.04.23 |
누리온 R-3.6.2 버전 설치 소개 (0) | 2020.04.10 |
누리온 OpenFOAM-7 버전 설치 소개(SKL) (0) | 2019.10.25 |