KISTI 슈퍼컴퓨팅 기술 블로그

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 gromacs-5.1.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템 누리온OS Version 리눅스 / CentOS 7.3 CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러 Intel 2018.3 Version MPI IntelMPI 2018.3 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정 누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다. [ ..

KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 누리온 시스템에 siesta-4.1-b3 source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다. 1. 설치 환경 구분내용 대상 시스템누리온 OS Version리눅스 / CentOS 7.3 CPUIntel(R) Xeon(R) Gold 6148 컴파일러Intel 2017.5 Version MPIIntelMPI 2017.5 Version 기타 Intel MKL Math Library 2. 설치 전 환경 설정KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설..

안녕하십니까? 슈퍼컴퓨팅본부입니다. 지난 3차 베타서비스에 이어 V100 GPU 9대를 추가한 KAT시스템을 아래와 같이 4차 베타서비스 합니다. GPU 컴퓨팅 및 최신 아키텍쳐의 CPU사용에 관심 있는 사용자분들께서는 사용신청해주시기 바랍니다. 1. 베타서비스 기간 2018년 12월 10일~2019년 2월 9일 (2개월간, 추후 변경가능) 2. 대상 GPU 활용이 필요한 연구 주제를 보유한 연구자 3. 신청기간 2018년 11월 21일 ~ 2018년 11월 29일까지 4. 신청방법 연구지원프로그램 신청시스템 ( https://enables.ksc.re.kr )을 통해 신청 5. 시스템 사양 계산노드 - 총 42노드 - single K40 GPU 8노드 (노드당 K40카드 한장) - dual V100 G..

각 컴파일러들에서 INTEL AVX-512(Advanced Vector Extensions 512) 를 활성화 시키는 옵션입니다.INTEL AVX-512 참고 : https://en.wikipedia.org/wiki/AVX-512 [GNU]- Skylake : -march=skylake-avx512- KNL : -march=knl [Intel]- Skylake : -xCORE-AVX512- KNL : -xMIC-AVX512※ 참고 : https://software.intel.com/en-us/articles/compiling-for-the-intel-xeon-phi-processor-and-the-intel-avx-512-isa [PGI]- Skylake : -tp=skylake- KNL : -tp=kn..

[오류 내용]/bin/sh^M: bad interpreter: No such file or directory [원인]dos 형식의 파일에서의 새줄 문자와 Unix 형식에서의 새줄 문자가 달라 ^M을 명령으로 인식해서 생기는 문제입니다. [조치사항]dos 포멧으로 작성된 파일을 vi를 이용해 ^M을 제거 하거나 dos2unix 명령어를 이용하여 Unix 파일 포멧으로 변경해주어야 합니다. [예제]dos2unix {파일명} - 참고 : https://ko.wikipedia.org/wiki/새줄_문자