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뉴론 OpenFOAM 사용자 지침서 본문

사용자 지침서/뉴론(Neuron) (GPU Cluster System)

뉴론 OpenFOAM 사용자 지침서

슈퍼컴퓨팅인프라센터 2020. 7. 9. 09:19

본 문서는 뉴론 시스템에서 OpenFOAM 소프트웨어 사용을 위한 기초적인 정보를 제공하고 있습니다.  

따라서, OpenFOAM 소프트웨어 사용법 및 뉴론/리눅스 사용법 등은 포함되어 있지 않습니다.  

뉴론/리눅스 사용법에 대한 정보는 KISTI 홈페이지 (https://www.ksc.re.kr)의 기술지원 > 지침서 내 뉴론 사용자 지침서 등을 참고하시기 바랍니다.

OpenFOAM 사용법에 대한 정보는 OpenFOAM 사이트(https://www.openfoam.comhttps://openfoam.orghttp://openfoamwiki.net)를 참고하시기 바랍니다.


1. 소프트웨어 설치 정보

(1) 설치 버전 

 - v1912


(2) 설치 위치 

 Version

 CPU 구분

 설치 경로

 비고

v1912

SKL

 /apps/applications/OpenFOAM/v1920/intel/18.0.2/impi/18.0.2/OpenFOAM

 


3. 소프트웨어 환경 설정 방법

(1) OpenFOAM-v1912 버전

 $ module load intel/18.0.2 mpi/impi-18.0.2

 $ source /apps/applications/OpenFOAM/v1920/intel/18.0.2/impi/18.0.2/OpenFOAM/OpenFOAM-v1912/etc/bashrc


4. 스케쥴러 작업 스크립트 파일 작성

 뉴론 시스템에서는 로그인 노드에서 Slurm 스케쥴러를 사용하여 작업을 제출해야 합니다. 


※ 아래 예제는 OpenFOAM 의 simpleFoam 에 대한 예제입니다. 

#!/bin/sh

#SBATCH -J OpenFOAM_job

#SBATCH -p skl

#SBATCH -N 2 # number of nodes

#SBATCH -n 8 # total process

#SBATCH -o %x_%j.out

#SBATCH -e %x_%j.err

#SBATCH --time=24:00:00

#SBATCH --comment openfoam

 

srun simpleFoam -parallel

 - 위에서 파란색으로 표기된 부분은 사용자가 적절히 수정해야 합니다.

 "#SBATCH --comment openfoam" 옵션이 없는 경우 작업제출이 되지 않습니다.

 - 작업 제출은 스크래치 디렉토리에서만 가능 합니다.

 - 스크래치 디스크는 작업 종료 후 일정 시간(2020년 7월 현재 정책: 15일)이 지나면 삭제되기 때문에, 작업이 완료 된경우 빠른 시일 내에 백업하시길 권장합니다. 

 - 기타 Slurm에 관련된 명령어 및 사용법은 뉴론 사용자 지침서를 참조하시면 됩니다.


5. 작업 제출 방법

 - 예제 : 스크립트 파일 이름이 run.sh 인 경우

 $ sbatch run.sh


6. 작업 상태 확인

 $ squeue (또는 squeue -u $USER) 


7. 제출된 작업을 강제로 종료

 - 사용 방법 : scancel {작업ID}

 - 작업ID는 qstat 명령어 실행 시 제일 왼쪽에 표시 되는 정보입니다.(ex. 12721)

 - 예제 : 작업ID 가 12721 인 경우

 $ scancel 12721


8. Slurm 상에서 사용 가능한 자원 확인

 $ sinfo


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