누리온 VASP 5.4.4 설치 (KNL버전)

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 5.4.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.

1. 설치 환경

구분	내용
대상 시스템	누리온
OS Version	리눅스 / CentOS 7.3
CPU	Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250
컴파일러	Intel 2018.3 Version
MPI	IntelMPI 2018.3 Version
기타	Intel MKL Math Library

2. 설치 전 환경 설정

  누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 

  환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,

  이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.

[ 환경 설정 ]

$ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3

3. vasp 5.4.4 버전 설치 과정

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고,

 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.  

설치 과정

$ tar xvzf vasp.5.4.4.tar.gz $ cd vasp.5.4.4 $ cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include $ vi makefile.include  - - - - - [ makefile.include 파일 수정 내용] 참고 $ make all

[make.include 파일 수정 내용]

ADDITIONAL_OPTS=-O3 -qopenmp -xMIC-AVX512 -align array64byte ADDITIONAL_OPTS_CC=-O3 -qopenmp -xMIC-AVX512 # Precompiler options CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC15_impi\" \ -DCACHE_SIZE=12000 -Davoidalloc \ -DMPI_BLOCK=8000  -Duse_collective \ -DnoAugXCmeta -Duse_bse_te \ -Dtbdyn \ -D_OPENMP -DPROFILING -Duse_shmem \ -Dshmem_bcast_buffer -Dsheme_rproj CPP = fpp -f_com=no -free -w0 $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS) FC = mpiifort -qopenmp -mkl=parallel ${ADDITIONAL_OPTS} FCL = mpiifort -mkl=parallel ${ADDITIONAL_OPTS} FREE = -free -names lowercase FFLAGS = -assume byterecl OFLAG = ${ADDITIONAL_OPTS} OFLAG_IN = $(OFLAG) DEBUG = -O0 MKL_PATH = $(MKLROOT)/lib/intel64 BLAS = LAPACK = BLACS =  SCALAPACK =  OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o INCS =-I$(MKLROOT)/include/fftw LLIBS = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS) OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o OBJECTS_O2 += fft3dlib.o # For what used to be vasp.5.lib CPP_LIB = $(CPP) FC_LIB = $(FC) CC_LIB = icc CFLAGS_LIB = -O FFLAGS_LIB = ${ADDITIONAL_OPTS} FREE_LIB = $(FREE) OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o # For the parser library CXX_PARS = icpc LIBS += parser LLIBS += -Lparser -lparser -lstdc++ # # Normally no need to change this SRCDIR = ../../src BINDIR = ../../bin #================================================ # GPU Stuff CPP_GPU    = -DCUDA_GPU -DRPROMU_CPROJ_OVERLAP -DUSE_PINNED_MEMORY -DCUFFT_MIN=28 -UscaLAPACK OBJECTS_GPU = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d_gpu.o fftmpiw_gpu.o CC         = icc CXX        = icpc CFLAGS     = -fPIC -DADD_ -Wall -openmp -DMAGMA_WITH_MKL -DMAGMA_SETAFFINITY -DGPUSHMEM=300 -DHAVE_CUBLAS CUDA_ROOT  ?= /usr/local/cuda/ NVCC       := $(CUDA_ROOT)/bin/nvcc -ccbin=icc CUDA_LIB   := -L$(CUDA_ROOT)/lib64 -lnvToolsExt -lcudart -lcuda -lcufft -lcublas GENCODE_ARCH    := -gencode=arch=compute_30,code=\"sm_30,compute_30\" \                    -gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \                    -gencode=arch=compute_60,code=\"sm_60,compute_60\" MPI_INC    = $(I_MPI_ROOT)/include64/